Se realiza por determinaciones analíticas volumétricas, colorimétricas y espectrofotométricas. En aguas potables se estudian todos los parámetros indicados en la Reglamentación Técnico-Sanitaria (R.D. 140/2003) y en aguas residuales se determinan DBO, DBO5, COT y sólidos en suspensión, además de efectuarse ensayos de toxicidad.